国产生化分析仪的参数设置包括样品与试剂量、试剂的选择、测定方法的选择、波长的选择、校正方法和分析时间的选择等。样品与试剂量的确定一般按照试剂说明书上的比例，并结合仪器的特性进行设置。试剂有单试剂法和双试剂法供操纵者选择，在反应过程中仅加一次试剂的方法称单试剂法，该法常用做终点分析；为了消除检测体系或标本的混浊带来的影响可选用双波长法或双试剂法，目前全自动生化分析仪的终点分析多用此法。

    波长的设定应根据特定反应产物对光吸收的特点进行选择测定，有色溶液则由其对光的特异性吸收波长而定，双波长测定过程中还要选择合适有效的副波长。医疗设备内设置的校正方法一般包含二点校正、多点校正、线性、非线性等。生化反应的时间是某一项目所特有的，分析时间的选择应根据所采用的测定方法的不同而异。